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中国植物主题数据库是基础科学数据共享网资助项目，由植物学学科积累深厚和专业数据库资源丰富的中科院植物所和中科院昆明植物所联合建设。 以Species 2000中国节点和中国植物志名录为基础，整合植物彩色照片、植物志文献记录、 化石植物名录与标本以及药用植物数据库，强调数据标准化和规范化。
系统建成后的基本数据量如下：
（1）植物名称数据库：155290条（包括科、属、种及种下名称，Species 2000中国节点有110,449条，中国植物志有44,841条）。
（2）植物图片数据库：18338种，1,009,386张（中国植物图像库283,317张，中国自然标本馆726,069张）。
（3）文献数据：共计3,652,312条名称—页码记录（BHL中国节点数据129,105条，BHL美国节点3,523,207条）。
（4）药用植物数据库：11,987种，22,562条记录。
（5）化石名录数据库：1093条，其中《中国化石蕨类植物》（2010）有953条，《中国煤核植物》（2009）有140条。
（6）化石标本数据库：312个名称，662份标本。
通过数据之间的关联，物种综合信息页面将会串联其不同的数据类型，在同一页面显示。