台湾中央研究院生物多样性研究中心典藏丰富的台湾本土植物资料、文献、珍贵标本、野生植物及栖地影像，可供学术研究、生态保育、环境影响评估、相关产业开发等之参考。将台湾本土植物标本采集记录、标本影像、植物生态照及植物分类相关文献等加以数位化，建置一套兼具文字与影像的台湾植物资源查询系统，提供各界人士使用，以期使此项资源受到更有效的运用，发挥更大功能。同时并配合网际网路空间资讯系统（WebGIS）的技术研发，整合标本采集地之经纬度数据，可依使用者需求自行制作「台湾植物分布图」，与标本资料库内容结合，并显示植物物种在台湾的分布状况，将地理分布与标本资料、物种文献与植物影像整合为「台湾本土植物资料库」。
台湾本土植物标本资料库
中央研究院植物标本馆典藏之标本目前已逾120,000号，其中采集自台湾本地者约85,000号，经由分析标本标签内容及网路上资料库查询栏位之互通性，并参考国际间重要之植物资料库，建立一套中英文双语，兼具文字记录、植物标本影像的台湾本土植物标本资料查询系统。
目前资料库建档内容统计：共76,027笔
台湾本土植物影像资料库
台湾本土植物影像资料库典藏以台湾原生维管束植物生态照为主要内容，保存珍贵的影像记录，记录了台湾宝贵的自然资源，并为专业学术研究奠定良好的基础。此外，精彩写实的生态照片，除可提供教学辅助参考之外，亦是一般大众认识台湾原生植物的最佳管道。
台湾本土植物文献资料库
台湾本土植物文献资料库以台湾原生维管束植物分类文献为主要典藏内容，建立一套台湾本土植物的分类书目资料系统，而将各时期、各分类群之资讯以资料库查询之方式呈现，其中以台湾早期植物分类文献资料之整理建档，提供植物学研究人员相当大之助益，同时有效进行标本馆馆藏文献之建档及管理。
台湾本土植物分布资料库
配合网际网路空间资讯系统（WebGIS）的技术研发，整合标本采集地之经纬度数据，制作「台湾植物采集地分布图」，与标本资料库内容结合，透过地图直接针对地区查询标本采集记录及植物资料，亦可由地图显示某种植物在台湾的分布状况；对台湾植被研究及生态、保育等方面将大有助益。